Esta rebelión no tuvo objetivos independientes, por cuanto los criollos carecieron de un programa definido, lo que daría lugar a que fueran ambiguos y oportunistas en sus planteos, fluctuando permanente entre los bandos enfrentados (españoles e indígenas). Si bien paralela a la rebelión de Túpac Amaru, solo coincidió por breve lapso con ella, debido a la enorme diferencia de intereses que las separaban, porque la rebelión indígena devino en una revolución social comenzando los indios a expropiar propiedades de españoles y criollos, demostrando así las enormes diferencias económicas y de privilegio que los separaban de los criollos. Al principio se habrían aliado a Túpac Amaru, pero cuando la relación de fuerzas se tornó desfavorable, fingieron lealtad a la Corona española y colaboraron en la represión, de manera de ser considerados fieles vasallos de España. Al adquirir proximidad temporal y espacial a los criollos en 1810, pudo haber influído en la gestación de la Revolución de Mayo en el Río de la Plata; si bien patriotas como el Deán Funes la denostaron. Con el paso del tiempo fue más reconocida, aunque erróneamente identificada con la sublevación de Túpac Amaru. De manera que hubo incompatibilidades entre las etapas de Carlos III y Carlos IV, probablemente porque los españoles comenzaron a pensar que no podían perder el apoyo de los criollos, sus aliados naturales, cuando empezaban a soplar vientos ideológicos emancipatorios en las colonias americanas y corrían serio peligro de perderlas, lo que supondría que el Consejo de Indias pudo haber enmascarado una resolución política detrás de un dictamen profesional cuando anuló la causa. De cualquier modo, esta rebelión encabezada por criollos representó una forma embrionaria de las posteriores sublevaciones independentistas lideradas por criollos, suponiendo una manera arcaica, caudillista y con móviles de ambición personal; dejando enmascarada una aparente aspiración a regirse por sí mismos, a decidir su propio destino sin imposiciones foráneas que se concretó en mayo de 1810.